(1)注意对杀菌灭藻剂物品的损坏。过氧乙酸浓度超过2000mg/L．不可用在大理石面上；作为室内气溶胶喷雾时，应将精密仪器用布单或塑料膜罩上；杀菌灭藻剂浸泡物品按时取出，以防损坏。

(2)掌握杀菌灭藻剂的性能。所有使用杀菌灭藻剂的人员必须首先仔细阅读产品说明书，熟悉使用方法和用量，了解产品使用注意事项。
(3)杀菌灭藻剂的正确配制。在了解杀菌灭藻剂原液浓度基础上，准确计算，保证足够的杀菌灭藻剂浓度。过氧化物类消毒剂或含杀菌灭藻剂一般现配现用。
(4)防止误饮、误食。使用无色透明的杀菌灭藻剂时，切勿将杀菌灭藻剂置于茶杯或饭碗等用具内，以免被误当水或饮料饮用，特别要防止儿童误饮。

(5)注意人员防护。配制过氧乙酸和过氧化氢时，应注意皮肤和眼睛的防护，若不慎将浓溶液溅到皮肤上，立即用清水冲洗。化学消毒剂喷雾，多数情况下均为无人条件，只有用1000mg／L过氧乙酸或15000mg／L过氧化氢水溶液气溶胶喷雾可以有人在，但不宜有老人和儿童及有呼吸道疾病的人在场。